Los secuenciadores de ADN portátiles son prometedores para monitorear microbios durante la producción de alimentos


Los dispositivos de mano son muy adecuados para el monitoreo ambiental durante la producción de alimentos y tienen ventajas clave en la facilidad de uso y en la identificación de una amplia variedad de bacterias, según un nuevo estudio publicado en la revista npj Science of Food .


por SciencePOD


El estudio, realizado por investigadores del Programa de Investigación de Alimentos Teagasc y el Centro de Investigación SFI de APC Microbiome Ireland, es el primero en probar secuenciadores de ADN portátiles como una solución de monitoreo microbiano de rutina para instalaciones de producción de alimentos .

Identificar los microbios presentes en nuestra comida es importante. Después de todo, pueden provocar el deterioro de los alimentos y enfermedades, por lo que los controles de rutina de la vida microbiana en las instalaciones de producción de alimentos son una necesidad. Sin embargo, las técnicas actuales para lograr esto, aunque probadas y comprobadas, tienen algunas limitaciones.

«Las pruebas de microbiología en la cadena alimentaria se han basado, y continúan, en pruebas de microbiología clásicas más antiguas, como el uso de placas de agar y petri», explicó el autor principal del estudio, el profesor Paul Cotter. «Este es un enfoque que requiere mucho tiempo y solo se identifican los microorganismos que se están analizando específicamente».

Ver: Hacer proteínas ‘superalimentos’ a partir de algas marinas

La secuenciación de ADN ofrece una alternativa. En lugar de cultivar muestras bacterianas en placas de Petri , puede analizar rápidamente el ADN bacteriano e identificar las especies en una muestra. ¿La captura? La secuenciación de ADN convencional implica costosos equipos de laboratorio y solo técnicos de laboratorio altamente capacitados pueden realizar el procedimiento y analizar los resultados.

Esta no es una buena opción para la vigilancia microbiana de rutina en instalaciones de producción de alimentos ocupadas. Una tecnología más nueva ofrece una secuenciación rápida del ADN con un dispositivo de mano fácil de usar , pero nadie había probado su potencial en la producción de alimentos, hasta ahora. El profesor Cotter y sus colegas, dirigidos por el Dr. Aoife McHugh, se propusieron investigar cómo se compararía dicha tecnología de secuenciación portátil con la secuenciación basada en laboratorio, utilizando muestras de hisopos de una instalación lechera en funcionamiento.

Sorprendentemente, el dispositivo de mano demostró ser similar al sistema de secuenciación de laboratorio más grande en términos de la cantidad de especies bacterianas que podría identificar en las muestras, lo que sugiere que tiene potencial como un dispositivo de monitoreo de rutina en la producción de alimentos. Sin embargo, el pequeño dispositivo requiere una cantidad mínima de ADN antes de que pueda funcionar correctamente.

Ver: Hongos permitirían extraer alimentos de residuos de la madera

En la instalación lechera bien limpia, simplemente no había suficientes bacterias en muchas de las muestras, por lo que los investigadores tuvieron que realizar un paso adicional para amplificar el ADN bacteriano antes de que hubiera suficiente para analizar. Este es un obstáculo menor, y los avances en la tecnología pueden ayudar a superarlo.

«Como microbiólogos, el uso de la secuenciación de ADN ha revolucionado nuestra comprensión de las fascinantes comunidades microbianas en el fondo de los océanos, las cimas de los icebergs y una gran variedad de otros entornos», dijo el profesor Cotter. «Si bien estos estudios tienen el potencial de tener un impacto en nuestras vidas a largo plazo, el uso de estas tecnologías para mejorar la calidad y la seguridad de los alimentos puede tener un impacto muy rápido en la vida cotidiana. Este estudio representa un paso clave hacia un día en el que no los expertos pueden utilizar herramientas de secuenciación de ADN para realizar pruebas microbiológicas en la cadena alimentaria «.