Científicos de CSIRO, la agencia científica nacional de Australia, han secuenciado el primer genoma completo del raro y esquivo pez mano moteado (Brachionichthys hirsutus), un pez marino en peligro crítico de extinción endémico de Tasmania.
por CSIRO
La especie , que antes abundaba en la costa sureste de Tasmania, ha disminuido en número. En 1996, se convirtió en el primer pez marino catalogado como en peligro crítico de extinción.
Los científicos estiman ahora que quedan menos de 2.000 individuos en estado salvaje.
La rápida disminución del pez mano moteado se atribuye a las prácticas pesqueras históricas, el desarrollo costero, el cambio climático y la llegada de especies invasoras.
El genoma es una herramienta fundamental para ayudar a conservar las especies, y para ello fue necesario un esfuerzo coordinado, liderado por la Iniciativa de Genómica Aplicada (AGI) de CSIRO.
El científico investigador principal de CSIRO, Dr. Gunjan Pandey, dijo que la secuencia del genoma ayudará a los esfuerzos en curso para aumentar las cifras de población y monitorear la diversidad genética .
«El genoma nos ayuda a comprender cómo funciona un organismo», afirmó el Dr. Pandey.
«Proporciona una base para comprender la expresión genética en la vida diaria y ofrece información sobre su historia evolutiva.
«Con el genoma, podemos ayudar a detectar especies, monitorear poblaciones e incluso estimar la esperanza de vida de los peces».
La investigadora principal, Carlie Devine, que se especializa en la conservación y gestión del pez mano moteado, dijo que esta rica información genética ayudará a informar la estrategia de conservación a largo plazo.
«Las medidas de conservación se están ampliando para incluir la genética, reconociendo que un enfoque multidisciplinario junto con la investigación ecológica es esencial para la conservación efectiva de las especies amenazadas», dijo Devine.
El Dr. Pandey dijo que la oportunidad de secuenciar el genoma del esquivo animal surgió cuando un pez mano moteado falleció por causas naturales en cautiverio.
«Trabajar con especies marinas como el pez mano moteado es notoriamente difícil», dijo el Dr. Pandey.
«El ADN se degrada rápidamente y se contamina con microorganismos.
«Esto hace que ensamblar un genoma puro sea extremadamente difícil».
El equipo logró secuenciar el genoma completo a partir de una pequeña cantidad de ADN de mala calidad, utilizando lo que se denomina un protocolo de bajo consumo de recursos. Esto se realizó en colaboración con el Centro de Recursos Biomoleculares de la Universidad Nacional de Australia.
«Somos uno de los tres únicos equipos a nivel mundial que utilizan este protocolo», afirmó el Dr. Pandey.
«Personalizamos todo el proceso, desde la configuración del laboratorio hasta el software bioinformático, para secuenciar un genoma de alta calidad a partir de ADN de mala calidad.
«Lo que antes requería de seis a doce meses, ahora lo podemos lograr en unos días. Esta tecnología es muy prometedora para comprender y conservar las especies en peligro de extinción en Australia y en todo el mundo».
Los científicos de CSIRO han estado monitoreando al pez mano moteado desde 1997, vigilando nueve poblaciones localizadas dentro del estuario de Derwent.
El enfoque múltiple de CSIRO para conservar el pez mano moteado incluye un programa de cría en cautiverio, así como enfoques innovadores para la restauración del hábitat.
