junio 29, 2022

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Múltiples genomas de alta calidad ensamblados a partir de 24 variedades de papas silvestres y 20 cultivadas


Un equipo de investigadores afiliados a múltiples instituciones en China trabajando con un colega de los Países Bajos y dos de los EE. UU. ha ensamblado 44 genomas de alta calidad de 24 variedades de papa silvestres y 20 cultivadas. 


por Bob Yirka, Phys.org


En su artículo publicado en la revista Nature , el grupo describe su secuenciación de variedades de patata y el análisis posterior. Juanita Gutiérrez-Valencia y Tanja Slotte, de la Universidad de Estocolmo, han publicado un artículo de News & Views en la misma edición de la revista que describe el trabajo y explica por qué estos estudios se han vuelto más importantes en los últimos años.

Como señalan Gutiérrez-Valencia y Slotte, las papas son el tercer cultivo más consumido en el mundo, solo por detrás del trigo y el arroz. Eso los convierte en «el cultivo alimentario no cerealero más importante del mundo», según los investigadores. Por lo tanto, es fundamental aprender más sobre ellos, ya que el calentamiento global amenaza con cambiar las formas y posiblemente los lugares donde se pueden cultivar papas. Con ese fin, los investigadores realizaron un extenso estudio genómico de 24 variedades silvestres y 20 variedades locales (papas cultivadas).

Una vez secuenciadas las variedades, los investigadores las analizaron en busca de datos que pudieran ser pertinentes en los próximos años. Descubrieron que las papas en general, en comparación con otros cultivos alimentarios , tienen genes más resistentes a las enfermedades (incluidos los que combaten el patógeno que causó la hambruna irlandesa de la papa). Sugieren que esto se debe a sus características de propagación basadas en tubérculos y las formas en que las variedades se han adaptado a diferentes entornos a medida que los agricultores humanos las exportaban a todo el mundo. También encontraron que las papas están más estrechamente relacionadas con los tomates.

Los investigadores también utilizaron la edición de genes CRISPR-Cas9 en algunas variedades para aprender más sobre el desarrollo de los tubérculos. Descubrieron un gen previamente desconocido que juega un papel en el desarrollo de los tubérculos, al mismo tiempo que se dieron cuenta de que la proteína que señala interactúa con una molécula importante para el desarrollo de los tubérculos.

Los investigadores concluyen que un trabajo como el suyo se está volviendo más importante a medida que los agricultores de todo el mundo se verán obligados a cambiar las prácticas establecidas para continuar proporcionando los alimentos necesarios para una población en crecimiento.



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